dientes manchados y porosos

tengo un niño de 3años 8meses que tiene los dientes manchados y porosos y ya la caries los estan picando porlo tanto estan protejidos con coronas de acero mi consulta es que si es por falta de calcio tiene este problema ya que el es alergico a la proteina de esta y al huevo y por lo tanto dejo de consumirla desde bebe y le mandaron leche de soya pero solo la tolero hasta 1año de edad desde ahi solo consume ades y quisiera que me asesoraran si es nesesario que consuma algun calcio y por cuanto tiempo esto si me preocupa porque cuando le salgan los permanentes tendra este mismo problema?